TABLE 2

Genomic characteristics of the K. variicola and K. quasipneumoniae strainsa

StrainSpeciesMLSTCapsulenifKPCCTX-MNDM-1SHV-OKP-
LEN core
SHV-OKP-
LEN plasmid
TEM
KPN325 K. variicola 1174KL33*+LEN-24SHV-12
KPN349 K. variicola 468KL60+LEN-24SHV-5
KPN458 K. variicola NFKL19+LEN-24SHV-12
KPN700 K. variicola 681KL143*+LEN-2
KPN771 K. variicola 681KL143*+LEN-2
KPN807 K. variicola NFKL105+CTX-M-15OKP-B-16TEM-166
KPN1264 K. variicola 454KL109*LEN-24SHV-30
KPN1401 K. variicola NFKL19+KPC-2LEN-20
KPN1415 K. variicola NFKL19+KPC-2LEN-4TEM-79
KPN1481 K. variicola 906KL10+CTX-M-15NDM-1LEN-16
KPN1556 K. variicola NFKL53*+LEN-24SHV-12
KPN1705 K. variicola NFKL153+LEN-24SHV-30
KPN1751 K. variicola 1456KL60+LEN-24SHV-12, SHV-66
KPN560 K. quasipneumoniae 1602KL53CTX-M-15OKP-B-19TEM-198
KPN712 K. quasipneumoniae NFKL101OKP-B-3SHV-12
KPN1132 K. quasipneumoniae 476KL57OKP-B-15SHV-12
KPN1398 K. quasipneumoniae 2133KL106*+CTX-M-15OKP-B-15TEM-166
KPN1470 K. quasipneumoniae 138KL1+CTX-M-15OKP-B-2TEM-33
KPN1533 K. quasipneumoniae 2351KL114+OKP-A-5SHV-12
KPN1648 K. quasipneumoniae 2351KL114+CTX-M-3OKP-A-5TEM-30
KPN1673 K. quasipneumoniae 1887KL121+OKP-B-8SHV-12
KPN1688 K. quasipneumoniae 1887KL121+OKP-B-8SHV-12
KPN1711 K. quasipneumoniae NFKL1+KPC-2OKP-A-7
KPN1715 K. quasipneumoniae 1887KL121*+OKP-B-8SHV-12
KPN1962 K. quasipneumoniae 196KL46OKP-A-5TEM-198
KPN2096 K. quasipneumoniae 414KL123OKP-B-8
KPN2105 K. quasipneumoniae 978KL125+CTX-M-3OKP-A-3
KPN2119 K. quasipneumoniae 978KL125+CTX-M-3OKP-A-3
NEK11 K. quasipneumoniae 138KL1+OKP-B-2
NEK12 K. quasipneumoniae NFKL16+OKP-B-5
NEK19 K. quasipneumoniae NFKL16+OKP-B-3TEM-198
NEK36 K. quasipneumoniae 283KL10+OKP-B-15
NEK42 K. quasipneumoniae NFKL33+OKP-A-11
NEK47 K. quasipneumoniae NFKL158+OKP-A-7
NEK56 K. quasipneumoniae 894KL58OKP-B-15
NEK59 K. quasipneumoniae NFKL128+OKP-A-10
NEK66 K. quasipneumoniae NFKL139OKP-B-1
NEK67 K. quasipneumoniae 477KL15+OKP-B-3
NEK118 K. quasipneumoniae NFKL13+OKP-A-11
NEK122 K. quasipneumoniae NFKL56+OKP-B-5
  • a The presence or absence of select antimicrobial resistance genes, MLST, capsule genotype, presence or absence of nif genes, and presence of SHV-LEN-OKP beta-lactamase in core genome and plasmids. Capsule loci that appear to be variants are indicated with an asterisk.